На восточной окраине Фенноскандии находятся две особо охраняемых природных территории – национальные парки «Водлозерский» и «Кенозерский». Они расположены в относительной близости друг от друга, занимают обширные таежные территории Республики Карелия и Архангельской области. Их отличает представленность старовозрастных лесов и характер сельскохозяйственной освоенности угодий. Видовой состав рукокрылых на территории этих ООПТ ранее не исследовался и с уверенностью можно было говорить об обитании там лишь северного кожанка. Специальные учеты летучих мышей на этих территориях проведены с использованием традиционных (паутинные сети, визуальные наблюдения) и современных (статический ультразвуковой детектор) методов. Учеты проводились на контрольных точках, автомобильных и водных маршрутах. Всего отловлено 28 летучих мышей 4-х видов (северный кожанок Eptesicus nilssonii Keyserling & Blasius 1839, ночницы водяная Myotis daubentonii Kuhl 1817, Брандта M. brandtii Eversmann 1845, усатая M. mystacinus Kuhl 1817), зарегистрировано 185 летучих мышей 7 видов (кроме перечисленных – бурый ушан Plecotus auritus L. 1758, рыжая вечерница Nyctalus noctula Schreber 1774, двуцветный кожан Vespertilio murinus L. 1758, прудовая ночница M. dasycneme Boie 1825, ночница Наттерера M. nattereri Kuhl 1817) и ночницы условной группы Брандта/усатая. Показаны относительное обилие (%) и относительная численность (экз./км маршрута) отдельных видов, а также характерное в целом для подзоны средней тайги доминирование в сообществах рукокрылых северного кожанка. Выявлены самые северные точки летнего обитания усатой ночницы на Европейском Севере России. Сравнительный анализ двух ООПТ по видовому составу, относительному обилию и относительной численности летучих мышей не выявил резких отличий по этим показателям.