Цель деятельности ИБ КарНЦ РАН состоит в проведении фундаментальных и поисковых научных исследований, направленных на получение новых знаний в области биологии и смежных естественных дисциплин, и прикладных исследований, касающихся разработки биологических основ охраны объектов растительного и животного мира и среды их обитания, управления биологическими ресурсами и разработки технологий их использования и восстановления. Предметом деятельности института являются живые системы на разных уровнях организации в различных природных средах и в экспериментальных условиях.