В статье приведена оценка экосистемного обмена диоксида углерода и эмиссии метана на мезо-олиготрофном и крупнобугристом болотах Северо-Востока России по результатам измерений методом микровихревых пульсаций в период вегетации. Исследованные болота различались по температурному режиму воздуха и почвы, продолжительности периода вегетации. Установлены различия скорости и продолжительности стока СО₂ между двумя типами болот. Суммарный нетто-обмен СО₂ на мезо-олиготрофном болоте в бесснежный период соответствовал 450 г/м², а на крупнобугристом – 150 г/м². Кумулятивный поток метана в экосистеме крупнобугристого болота в два раза ниже, чем на мезо-олиготрофном, что обусловлено присутствием многолетнемерзлых грунтов. В исследованных типах болот травянистые мочажины являлись основными источниками метана.